Redmond Smyth

Biographie

Redmond Smyth est directeur de recherche au Centre national de la recherche scientifique (CNRS) et travaille à l'Institut de biologie moléculaire et cellulaire (IBMC) de l'université de Strasbourg.

Il a obtenu sa licence en sciences naturelles à l'université de Cambridge (Royaume-Uni). Il s'est ensuite installé en Australie, où il a obtenu son doctorat en virologie au Burnet Institute via le département de biochimie et de biologie moléculaire de l'université Monash de Melbourne. Ses recherches postdoctorales l'ont conduit à l'université de Strasbourg (France), où il s'est formé à la biochimie de l'ARN et a été l'un des pionniers des méthodologies à haut débit pour l'étude de la structure et de la fonction de l'ARN. En 2015, il a été recruté au CNRS en tant que chargé de recherche. En 2018, il a créé son groupe de recherche à l'Institut Helmholtz pour la recherche sur les infections à ARN (HIRI) de Würzburg (Allemagne), où il a été nommé maître de conférences à l'université Julius-Maximilian. Au cours des six années suivantes, son laboratoire a développé une série de technologies de plus en plus sophistiquées afin d’analyser les interactions entre les virus et leurs hôtes.

Depuis 2024, date à laquelle il est revenu à Strasbourg, le Dr Smyth dirige le laboratoire Biologie des génomes de virus au sein de l’unité Architecture et réactivité de l’ARN (ARN) de l’IBMC. Son équipe étudie différents virus à ARN tels que le VIH, la grippe et le coronavirus afin de comprendre comment ces virus se multiplient au sein des cellules et de mettre au point de nouvelles méthodes permettant de les combattre efficacement.

Fellowship 2026

Dates - 01/09/2026-31/08/2028

Résumé du projet

CRIBLAGE OPTIQUE DES FACTEURS DE L’HÔTE RÉGULANT L’ASSEMBLAGE DU VIRUS DE LA GRIPPE

Ce projet vise à élucider comment des facteurs cellulaires de l’hôte régulent l’assemblage des virus influenza (virus de la grippe), une étape cruciale mais encore mal comprise du cycle viral. Ces virions doivent incorporer exactement huit segments d’ARN distincts dans chaque particule pour être pleinement infectieux. Ce processus reposerait sur des interactions ARN–ARN hautement spécifiques assurant un assemblage sélectif du génome. Cependant, la coordination de ces interactions dans cet environnement cellulaire complexe reste encore largement méconnue. Il est probable que ce processus très sélectif soit facilité par des facteurs de l’hôte, mais les méthodes actuelles de criblage génétique ne permettent pas de résoudre ces mécanismes, car elles ne peuvent pas étudier les étapes tardives de l’assemblage. Pour pallier cette lacune, le projet développera une approche innovante de criblage optique multiplexé combinant imagerie à haut contenu et séquençage in situ, permettant de visualiser directement la localisation des ARN viraux et leurs perturbations par extinction génique médiée par CRISPR à l’échelle de la cellule unique.

Les recherches s’articulent autour de deux objectifs principaux. Premièrement, l’équipe construira une plateforme automatisée de microfluidique et d’imagerie en réutilisant un instrument de séquençage Illumina HiSeq pour l’imagerie multicycles et le décodage des codes-barres. Cela permettra une analyse évolutive, reproductible et à haut débit des phénotypes spatiaux. Deuxièmement, cette plateforme sera utilisée pour réaliser des criblages CRISPRi ciblés afin d’identifier les facteurs de l’hôte impliqués dans l’export nucléaire de l’ARN viral et son trafic intracellulaire, des étapes clés nécessaires à l’assemblage correct du génome et à la coordination des interactions entre segments.

S’appuyant sur le développement antérieur de méthodologies de détection spatiale de l’ARN, le projet intègre des expertises en biologie de l’ARN, en imagerie et en ingénierie du génome. Il bénéficie de solides collaborations en microfluidique, en interactions hôte–pathogène et en analyse computationnelle. À son terme, il fournira le premier criblage génétique ciblant spécifiquement l’assemblage du virus influenza et identifiera de nouveaux facteurs de l’hôte impliqués dans l’empaquetage du génome. Au-delà de la virologie, il établira une plateforme polyvalente et en accès ouvert d’imagerie et de séquençage applicable à un large éventail de questions en biologie spatiale, positionnant Strasbourg comme un pôle de technologies avancées de criblage optique et ouvrant la voie à de futures études à l’échelle du génome sur des processus cellulaires complexes.